電車でＧＯ！プロフェッショナル仕様 発売：１９９９年１２月１０日　　対応：ＰｌａｙＳｔａｔｉｏｎ

過去２作で登場した路線を更にバージョンアップし、ディスク限界にまで詰め込んだPSオリジナルソフトが降臨！運転車種及びダイヤもかなり多く、リアル感も相当高まっている。

登場路線：秋田・東北新幹線（奥羽本線・田沢湖線　秋田〜大曲〜盛岡〜新花巻）、ほくほく・上越線（直江津〜六日町〜越後湯沢） 　　　　　　　京浜東北線（品川〜上野・品川〜横浜）、山手線内回り（渋谷〜東京）、東海道線（品川〜横浜） 　　　　　　　JR嵯峨野線（亀岡〜京都）、JR京都線（京都〜新大阪）、大阪環状線内回り（大阪〜天王寺）、鹿児島本線（博多〜小倉） 運転車両：E3系、200系、701系、HK100形、681系2000番台、209系、205系、113系、185系、キハ58系、103系、223系、813系、883系

・条件をクリアすることにより運転できる車種やダイヤが増える。 ・路線ナビゲーター（先の標識及び信号状態を表示）追加 ・京浜東北線や山手線の保安装置がATCとなった。 ・電GO!2では隠し路線だった東北新幹線を最初から運転できる。 ・ある条件をクリアすると2路線の通し運転ダイヤが何種類か登場する。 ・ベリーハードでノーコンティニュークリアした路線は天候を変えて運転することができる。 ・VVVF音の基本音が全てGTO（まだやはり…）。 ・動き出す時の音がちょいと不快（「フォン」って…またですか？）。 ・実は普通に運転していてもある区間で10秒くらい遅延してしまうダイヤがある。 ・最後に登場する151系第1こだまを現代の風景で走らせるといった無理ある演出。